L'interaction qui se produit lorsqu'un atome d'hydrogène, par covalence à un atome électronégatif (comme après), interagit avec un autre atome pour former les agrégats après...Y. le lien le plus court et le plus fort est indiqué comme après, alors que l'interaction secondaire et plus faible est écrit comme H....Y. donc après est un donneur de proton, tandis que (Y) est un accepteur de proton qui souvent contient la paire d'électrons libres et peut servir de base. Le plus fort des liaisons hydrogène se forment entre le plus électronégatif (A) atomes tels que le fluor, d'azote et d'oxygène qui interagissent avec les atomes (Y) ayant l'électronégativité supérieure à celle de l'hydrogène (C, N, O, S, Se, F, Cl, Br, I). Les plus faibles de l'hydrogène liaisons sont formées par des protons acides des groupes c – h, comme dans le chloroforme et l'acétylène et π-Elektronen oléfines et aromatiques agissant comme (Y).