Dans l'application des biotechnologies à l'agriculture, les principales zones impliquent la manipulation de plantes cultivées et de la manipulation d'associates microbiennes ou d'invertébrés, de plantes cultivées et les mauvaises herbes. Objectifs technologique peuvent être obtenus par croisement et de sélection conventionnelle ou par génie génétique des plantes, des microbes ou invertébrés, ou par l'intermédiaire de manipulation de l'environnement. Ces technologies peuvent être combinées dans divers systèmes agronomiques avec les pratiques traditionnelles telles que les pesticides chimiques ou des engrais. Jeu de champignons un rôle croissant dans agribiotechnology comme agents de lutte biologique, comme mycorhiziens associés des plantes racines, comme agents pour la dégradation de la lignocellulose et d'autres formes de biorestauration (l'application des micro-organismes se biodégrader des polluants), ou comme des cultures vivrières qui utilisent des déchets agricoles comme substrat. Dans la transformation des aliments et boissons, champignons offre un tableau des enzymes et des additifs naturels de saveur et de couleur.