Le mésoderme (ou mésoblaste), par opposition à l'endoderme et à l'ectoderme, est le feuillet cellulaire intermédiaire de l'embryon des métazoaires qui se met en place au moment de la gastrulation. Cependant, seuls les métazoaires triploblastiques le possèdent. En effet, les porifères (éponges) et les cnidaires (méduses, coraux, hydres, anémones de mer, etc.) en sont dépourvus. Ils possèdent par contre une mésoglée, qui n'est pas un feuillet embryonnaire et est d'ailleurs pauvre en cellules. Le mésoderme limite également les cavités séreuses (ou cavités cœlomiques) d'origine mésoblastique.

Le mésoderme est ainsi le feuillet embryonnaire qui produit une grande partie des tissus conjonctifs (la majorité des os, le derme…), des tissus musculaires ainsi que de la chorde.