La capacité des systèmes biologiques et chimiques à établir une distinction entre les molécules et de réglementer le comportement en conséquence. Comment assembler des molécules est fondamentale dans les disciplines comme la biochimie, chimie médicinale, science des matériaux et sciences de la séparation. Une bonne donne des efforts ont été dépensée pour tenter d'évaluer les forces intermoléculaires sous-jacentes. Les forces faibles qui agissent sur de courtes distances (liaisons hydrogène, interactions de van der Waals et empilage des aryl) fournissent la plupart de la sélectivité observée en chimie biologique et permettent la reconnaissance moléculaire. La reconnaissance événement lance comportement telles que la réplication dans les acides nucléiques, la réponse immunitaire en anticorps, transduction de signal dans les récepteurs et la réglementation en enzymes. La plupart des études de reconnaissance en chimie organique ont été inspirés par ces phénomènes biologiques. La tâche de chimie bioorganique à développer des systèmes capables d'un tel comportement complexe avec des molécules qui sont compréhensibles et gérable en taille, c'est-à-dire, avec des systèmes modèles.