Peinture chromosomique dans son sens original (telle qu'appliquée aux humains et autres animaux) est défini comme l'utilisation de sondes marquées fluorescent, spécifiques des chromosomes pour visualiser des chromosomes entiers ou régions chromosomiques à grande échelle. Ces sondes sont obtenus à partir des chromosomes ou de segments de chromosomes isolé soit par débit de tri (séparation des chromosomes en suspension sur la base de leur fluorescence relative à l'aide d'un cytomètre de flux/trieur) ou l'isolement de la microdissection d'acide désoxyribonucléique (ADN) d'un type particulier de chromosomes ou de sa part à l'aide d'une pipette microcapillaire fine. L'ADN isolé des sondes sont amplification en chaîne par polymérase (PCR), fluorescent marqués et visualisés sur des préparations chromosomiques sur une lame microscopique. De cette technique est communément connu comme la fluorescence en hybridation in situ (FISH) et il se réfère à la cartographie physique de la recombinaison (hybridation) de fluorescent marqué ADN ou acide ribonucléique (ARN) des sondes avec des séquences d'acides nucléiques complémentaires dans les chromosomes ou les noyaux.