Les récifs coralliens sont parmi les plus divers sur terre. Cette diversité se retrouve à faible (espèces) et les niveaux taxonomiques (phylum) de haut et comprend cryptofauna vivant dans le substrat (alésage par exemple, les éponges, les vers et les bivalves ; sessiles incrustation des bryozoaires, éponges, les tuniciers et les vers ; mobiles vers, mollusques, échinodermes et crustacés), épifaune sessile sur le substrat de surface (par exemple, scléractinien, coraux, éponges et algues corallines et charnues), et suprabenthiques de poissons dans la colonne d'eau sus-jacente. Environ 93 000 espèces ont été décrites dans le monde entier sur les récifs modernes, bien que les espèces de 500 000 à 1 million sont estimées à habiter les récifs (comparativement à 20 millions d'espèces dans les forêts tropicales humides). En plus de la situation tropicale de récifs de corail, un certain nombre d'autres facteurs semble être responsables de cette grande biodiversité, dont l'hétérogénéité physique complexe biologiquement générée, spécialisations sophistiquées, espèces communes (morphologiquement semblables) et co-évolués associations entre espèces.