Deoxys a quatre Formes, chacune avec une apparence différente. Les principales composantes qui sont constantes pour toutes les Formes de quatre sont une dominante couleur orange rougeâtre, avec un visage vert bleuté et trois points de mêmes couleur que son visage situé dans un triangle équilatéral pointant vers le haut sur son dos. Il est en général une bande pourpre sur le visage où un nez serait et il possède un orgue cristallin violet dans sa poitrine. Ses yeux est de couleur blanche et circulaire à l'intérieur de l'oeil au beurre noir en forme de douilles arrondi parallélogrammes. Dans le film Destiny Deoxys, il y a un deuxième Deoxys possédant un organe cristallin vert et rayure sur son visage. Autres variétés de couleur, le cas échéant, outre les variétés vertes et pourpres, sont inconnues.